1955年由宕昌县、岷县析置舟曲县。境内有白龙江，藏语称为舟曲，因水为名。

        1955年12月26日国务院批复同意撤销甘南藏族自治州原属的舟曲、碌曲、玛曲3个行政委员会的组织，并分别设舟曲县、碌曲县、玛曲县。舟曲县管辖的区域是：原宕昌县（原名西固县）的峰叠区、武坪区、城关区、阳乡，原属岷县的洛大乡、官鹅乡、大河坝乡和原属武都县的坪牙乡等地区，并且把这些地区调整为3个区、25个乡。县人民委员会驻原西固县城。4月9日成立。

        2000年，舟曲县辖22个乡：城关乡、大川乡、三角坪乡、池干乡、八楞乡、武坪乡、憨班乡、峰迭乡、坪定乡、江盘乡、弓子石乡、中牌乡、南峪乡、插岗乡、拱坝乡、大年乡、铁坝乡、博峪乡、曲瓦乡、巴藏乡、立节乡、大峪乡。

        2007年辖19个乡镇：城关镇、大川镇、曲瓦乡、巴藏乡、大峪乡、立节乡、憨班乡、峰迭乡、坪定乡、江盘乡、东山乡、南峪乡、果耶乡、八楞乡、武坪乡、插岗乡、拱坝乡、曲吿纳乡、博峪乡。

　　根据2007年人口普查数据：全县总人口138432人，其中各民族人口数为：汉族91405人、藏族46735人、回族241人、满族28人、蒙古族9人、撒拉族3人。